Protein–RNA interactions for Protein: P43146

DCC, Netrin receptor DCC, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCCP43146 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DCCP43146 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
DCCP43146 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DCCP43146 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DCCP43146 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DCCP43146 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DCCP43146 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DCCP43146 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DCCP43146 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DCCP43146 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
DCCP43146 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
DCCP43146 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DCCP43146 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DCCP43146 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DCCP43146 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DCCP43146 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DCCP43146 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DCCP43146 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DCCP43146 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DCCP43146 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DCCP43146 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DCCP43146 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DCCP43146 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DCCP43146 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DCCP43146 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DCCP43146 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DCCP43146 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DCCP43146 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
DCCP43146 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
DCCP43146 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
DCCP43146 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DCCP43146 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DCCP43146 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DCCP43146 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DCCP43146 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DCCP43146 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DCCP43146 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DCCP43146 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DCCP43146 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DCCP43146 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DCCP43146 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
DCCP43146 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DCCP43146 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DCCP43146 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
DCCP43146 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DCCP43146 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DCCP43146 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DCCP43146 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
DCCP43146 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DCCP43146 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DCCP43146 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DCCP43146 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
DCCP43146 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DCCP43146 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DCCP43146 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DCCP43146 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DCCP43146 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DCCP43146 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DCCP43146 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DCCP43146 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DCCP43146 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DCCP43146 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DCCP43146 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DCCP43146 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DCCP43146 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DCCP43146 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DCCP43146 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DCCP43146 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DCCP43146 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DCCP43146 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DCCP43146 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DCCP43146 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
DCCP43146 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DCCP43146 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DCCP43146 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DCCP43146 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
DCCP43146 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DCCP43146 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DCCP43146 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DCCP43146 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DCCP43146 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
DCCP43146 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
DCCP43146 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DCCP43146 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DCCP43146 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DCCP43146 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DCCP43146 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DCCP43146 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DCCP43146 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DCCP43146 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
DCCP43146 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DCCP43146 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DCCP43146 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DCCP43146 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DCCP43146 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DCCP43146 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DCCP43146 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DCCP43146 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DCCP43146 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DCCP43146 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms