Protein–RNA interactions for Protein: P43007

SLC1A4, Neutral amino acid transporter A, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A4P43007 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC1A4P43007 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC1A4P43007 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC1A4P43007 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC1A4P43007 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC1A4P43007 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC1A4P43007 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC1A4P43007 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC1A4P43007 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC1A4P43007 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC1A4P43007 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC1A4P43007 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC1A4P43007 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC1A4P43007 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC1A4P43007 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC1A4P43007 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC1A4P43007 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC1A4P43007 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC1A4P43007 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC1A4P43007 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC1A4P43007 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC1A4P43007 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC1A4P43007 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC1A4P43007 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC1A4P43007 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC1A4P43007 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC1A4P43007 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC1A4P43007 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC1A4P43007 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC1A4P43007 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC1A4P43007 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC1A4P43007 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC1A4P43007 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC1A4P43007 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC1A4P43007 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC1A4P43007 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC1A4P43007 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC1A4P43007 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC1A4P43007 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC1A4P43007 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC1A4P43007 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC1A4P43007 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC1A4P43007 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC1A4P43007 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC1A4P43007 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC1A4P43007 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC1A4P43007 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC1A4P43007 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC1A4P43007 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC1A4P43007 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC1A4P43007 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC1A4P43007 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC1A4P43007 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC1A4P43007 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC1A4P43007 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC1A4P43007 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms