Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TMPOP42166 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMPOP42166 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMPOP42166 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMPOP42166 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TMPOP42166 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TMPOP42166 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMPOP42166 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMPOP42166 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMPOP42166 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMPOP42166 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMPOP42166 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMPOP42166 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMPOP42166 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TMPOP42166 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMPOP42166 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMPOP42166 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMPOP42166 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMPOP42166 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMPOP42166 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMPOP42166 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMPOP42166 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMPOP42166 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMPOP42166 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMPOP42166 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMPOP42166 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMPOP42166 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMPOP42166 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMPOP42166 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMPOP42166 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMPOP42166 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMPOP42166 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMPOP42166 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMPOP42166 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMPOP42166 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMPOP42166 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMPOP42166 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMPOP42166 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMPOP42166 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMPOP42166 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMPOP42166 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMPOP42166 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMPOP42166 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMPOP42166 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMPOP42166 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMPOP42166 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMPOP42166 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMPOP42166 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMPOP42166 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMPOP42166 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMPOP42166 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMPOP42166 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMPOP42166 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMPOP42166 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMPOP42166 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMPOP42166 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMPOP42166 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMPOP42166 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TMPOP42166 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMPOP42166 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMPOP42166 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMPOP42166 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMPOP42166 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMPOP42166 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TMPOP42166 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMPOP42166 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TMPOP42166 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMPOP42166 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TMPOP42166 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMPOP42166 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMPOP42166 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMPOP42166 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMPOP42166 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMPOP42166 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMPOP42166 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMPOP42166 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMPOP42166 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMPOP42166 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMPOP42166 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMPOP42166 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMPOP42166 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMPOP42166 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMPOP42166 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMPOP42166 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMPOP42166 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMPOP42166 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TMPOP42166 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMPOP42166 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMPOP42166 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMPOP42166 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMPOP42166 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMPOP42166 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMPOP42166 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMPOP42166 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMPOP42166 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMPOP42166 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
TMPOP42166 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMPOP42166 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMPOP42166 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMPOP42166 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms