Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPB2P35606 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
COPB2P35606 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
COPB2P35606 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPB2P35606 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
COPB2P35606 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COPB2P35606 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
COPB2P35606 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COPB2P35606 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
COPB2P35606 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COPB2P35606 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPB2P35606 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPB2P35606 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPB2P35606 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPB2P35606 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
COPB2P35606 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPB2P35606 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPB2P35606 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPB2P35606 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
COPB2P35606 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPB2P35606 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPB2P35606 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPB2P35606 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPB2P35606 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPB2P35606 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPB2P35606 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPB2P35606 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPB2P35606 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPB2P35606 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPB2P35606 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPB2P35606 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPB2P35606 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPB2P35606 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPB2P35606 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPB2P35606 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPB2P35606 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPB2P35606 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
COPB2P35606 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPB2P35606 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPB2P35606 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
COPB2P35606 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPB2P35606 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPB2P35606 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPB2P35606 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPB2P35606 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPB2P35606 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPB2P35606 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPB2P35606 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPB2P35606 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPB2P35606 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPB2P35606 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPB2P35606 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPB2P35606 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPB2P35606 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPB2P35606 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPB2P35606 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPB2P35606 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPB2P35606 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
COPB2P35606 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPB2P35606 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
COPB2P35606 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPB2P35606 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPB2P35606 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPB2P35606 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPB2P35606 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPB2P35606 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPB2P35606 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPB2P35606 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPB2P35606 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPB2P35606 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPB2P35606 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPB2P35606 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPB2P35606 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPB2P35606 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPB2P35606 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPB2P35606 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPB2P35606 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPB2P35606 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPB2P35606 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPB2P35606 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPB2P35606 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPB2P35606 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPB2P35606 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPB2P35606 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPB2P35606 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPB2P35606 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPB2P35606 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPB2P35606 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPB2P35606 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPB2P35606 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPB2P35606 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPB2P35606 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPB2P35606 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPB2P35606 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPB2P35606 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPB2P35606 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPB2P35606 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPB2P35606 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPB2P35606 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPB2P35606 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms