Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PCGF2P35227 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PCGF2P35227 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms