Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CPS1P31327 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CPS1P31327 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CPS1P31327 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CPS1P31327 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CPS1P31327 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CPS1P31327 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CPS1P31327 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CPS1P31327 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CPS1P31327 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CPS1P31327 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CPS1P31327 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CPS1P31327 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CPS1P31327 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CPS1P31327 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CPS1P31327 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CPS1P31327 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CPS1P31327 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CPS1P31327 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CPS1P31327 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CPS1P31327 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CPS1P31327 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CPS1P31327 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CPS1P31327 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CPS1P31327 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CPS1P31327 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CPS1P31327 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CPS1P31327 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CPS1P31327 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CPS1P31327 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CPS1P31327 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CPS1P31327 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CPS1P31327 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CPS1P31327 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CPS1P31327 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CPS1P31327 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CPS1P31327 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CPS1P31327 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CPS1P31327 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CPS1P31327 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CPS1P31327 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CPS1P31327 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CPS1P31327 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CPS1P31327 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CPS1P31327 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CPS1P31327 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CPS1P31327 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CPS1P31327 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CPS1P31327 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CPS1P31327 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CPS1P31327 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CPS1P31327 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CPS1P31327 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CPS1P31327 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CPS1P31327 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CPS1P31327 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CPS1P31327 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CPS1P31327 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CPS1P31327 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CPS1P31327 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CPS1P31327 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CPS1P31327 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CPS1P31327 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CPS1P31327 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CPS1P31327 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CPS1P31327 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CPS1P31327 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CPS1P31327 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CPS1P31327 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CPS1P31327 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CPS1P31327 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CPS1P31327 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CPS1P31327 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CPS1P31327 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CPS1P31327 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CPS1P31327 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CPS1P31327 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CPS1P31327 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CPS1P31327 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CPS1P31327 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CPS1P31327 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CPS1P31327 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CPS1P31327 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CPS1P31327 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CPS1P31327 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CPS1P31327 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CPS1P31327 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CPS1P31327 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CPS1P31327 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CPS1P31327 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CPS1P31327 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CPS1P31327 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CPS1P31327 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CPS1P31327 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CPS1P31327 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CPS1P31327 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CPS1P31327 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CPS1P31327 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CPS1P31327 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CPS1P31327 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms