Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC13P31276 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms