Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HOXA7P31268 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXA7P31268 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms