Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PTAFRP25105 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTAFRP25105 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms