Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TNFSF4P23510 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms