Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDCP20941 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDCP20941 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDCP20941 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDCP20941 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDCP20941 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDCP20941 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDCP20941 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCP20941 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCP20941 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCP20941 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCP20941 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCP20941 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCP20941 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCP20941 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCP20941 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCP20941 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCP20941 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCP20941 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCP20941 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCP20941 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCP20941 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCP20941 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCP20941 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCP20941 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCP20941 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCP20941 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCP20941 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCP20941 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDCP20941 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCP20941 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCP20941 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCP20941 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCP20941 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCP20941 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCP20941 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCP20941 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCP20941 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCP20941 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCP20941 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCP20941 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCP20941 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCP20941 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCP20941 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCP20941 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCP20941 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCP20941 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCP20941 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCP20941 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCP20941 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCP20941 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCP20941 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCP20941 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCP20941 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCP20941 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCP20941 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCP20941 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCP20941 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCP20941 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCP20941 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCP20941 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDCP20941 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCP20941 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCP20941 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCP20941 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCP20941 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCP20941 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCP20941 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCP20941 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCP20941 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCP20941 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCP20941 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCP20941 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCP20941 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCP20941 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCP20941 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCP20941 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCP20941 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCP20941 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCP20941 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCP20941 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCP20941 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCP20941 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCP20941 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDCP20941 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDCP20941 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDCP20941 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDCP20941 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDCP20941 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCP20941 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCP20941 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCP20941 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCP20941 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCP20941 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCP20941 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCP20941 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCP20941 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCP20941 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCP20941 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCP20941 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms