Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDSP20132 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDSP20132 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDSP20132 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDSP20132 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDSP20132 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDSP20132 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDSP20132 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDSP20132 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDSP20132 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDSP20132 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDSP20132 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDSP20132 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDSP20132 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDSP20132 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDSP20132 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDSP20132 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDSP20132 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDSP20132 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDSP20132 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SDSP20132 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDSP20132 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDSP20132 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDSP20132 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDSP20132 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDSP20132 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDSP20132 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDSP20132 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDSP20132 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDSP20132 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDSP20132 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDSP20132 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDSP20132 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDSP20132 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDSP20132 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDSP20132 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDSP20132 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDSP20132 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDSP20132 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDSP20132 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDSP20132 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDSP20132 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDSP20132 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SDSP20132 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDSP20132 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDSP20132 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDSP20132 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDSP20132 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDSP20132 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDSP20132 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDSP20132 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDSP20132 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDSP20132 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SDSP20132 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDSP20132 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDSP20132 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDSP20132 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDSP20132 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SDSP20132 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDSP20132 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDSP20132 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SDSP20132 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SDSP20132 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDSP20132 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDSP20132 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDSP20132 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDSP20132 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDSP20132 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDSP20132 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDSP20132 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDSP20132 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDSP20132 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDSP20132 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SDSP20132 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SDSP20132 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SDSP20132 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SDSP20132 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SDSP20132 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SDSP20132 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SDSP20132 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SDSP20132 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SDSP20132 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SDSP20132 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SDSP20132 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SDSP20132 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SDSP20132 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SDSP20132 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SDSP20132 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SDSP20132 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SDSP20132 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SDSP20132 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SDSP20132 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SDSP20132 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SDSP20132 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDSP20132 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDSP20132 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDSP20132 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDSP20132 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDSP20132 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SDSP20132 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms