Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATP2B1P20020 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms