Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SMIM10L2BP0DMW5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMIM10L2BP0DMW5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMIM10L2BP0DMW5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMIM10L2BP0DMW5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMIM10L2BP0DMW5 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMIM10L2BP0DMW5 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMIM10L2BP0DMW5 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMIM10L2BP0DMW5 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMIM10L2BP0DMW5 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMIM10L2BP0DMW5 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMIM10L2BP0DMW5 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMIM10L2BP0DMW5 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMIM10L2BP0DMW5 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMIM10L2BP0DMW5 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMIM10L2BP0DMW5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMIM10L2BP0DMW5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMIM10L2BP0DMW5 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms