Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
PKHD1P08F94 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms