Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms