Protein–RNA interactions for Protein: O75400

PRPF40A, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40AO75400 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF40AO75400 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF40AO75400 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPF40AO75400 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF40AO75400 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF40AO75400 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF40AO75400 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF40AO75400 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF40AO75400 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF40AO75400 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF40AO75400 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF40AO75400 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF40AO75400 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF40AO75400 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF40AO75400 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF40AO75400 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF40AO75400 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF40AO75400 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF40AO75400 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF40AO75400 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF40AO75400 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF40AO75400 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF40AO75400 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF40AO75400 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF40AO75400 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF40AO75400 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF40AO75400 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF40AO75400 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF40AO75400 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF40AO75400 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF40AO75400 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF40AO75400 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF40AO75400 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF40AO75400 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF40AO75400 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF40AO75400 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF40AO75400 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF40AO75400 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF40AO75400 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF40AO75400 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPF40AO75400 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRPF40AO75400 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRPF40AO75400 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRPF40AO75400 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRPF40AO75400 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRPF40AO75400 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRPF40AO75400 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRPF40AO75400 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRPF40AO75400 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPF40AO75400 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms