Protein–RNA interactions for Protein: O75161

NPHP4, Nephrocystin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4O75161 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NPHP4O75161 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
NPHP4O75161 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
NPHP4O75161 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
NPHP4O75161 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
NPHP4O75161 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
NPHP4O75161 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
NPHP4O75161 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
NPHP4O75161 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NPHP4O75161 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NPHP4O75161 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NPHP4O75161 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NPHP4O75161 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NPHP4O75161 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NPHP4O75161 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NPHP4O75161 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NPHP4O75161 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NPHP4O75161 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NPHP4O75161 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NPHP4O75161 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NPHP4O75161 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NPHP4O75161 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NPHP4O75161 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NPHP4O75161 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NPHP4O75161 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NPHP4O75161 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NPHP4O75161 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
NPHP4O75161 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NPHP4O75161 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NPHP4O75161 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NPHP4O75161 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NPHP4O75161 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NPHP4O75161 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NPHP4O75161 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NPHP4O75161 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
NPHP4O75161 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NPHP4O75161 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NPHP4O75161 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NPHP4O75161 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NPHP4O75161 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NPHP4O75161 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NPHP4O75161 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NPHP4O75161 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NPHP4O75161 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NPHP4O75161 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NPHP4O75161 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
NPHP4O75161 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NPHP4O75161 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NPHP4O75161 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NPHP4O75161 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NPHP4O75161 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NPHP4O75161 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NPHP4O75161 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NPHP4O75161 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NPHP4O75161 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NPHP4O75161 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
NPHP4O75161 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
NPHP4O75161 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
NPHP4O75161 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NPHP4O75161 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NPHP4O75161 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NPHP4O75161 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NPHP4O75161 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NPHP4O75161 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NPHP4O75161 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NPHP4O75161 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NPHP4O75161 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NPHP4O75161 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NPHP4O75161 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NPHP4O75161 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NPHP4O75161 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NPHP4O75161 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
NPHP4O75161 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NPHP4O75161 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NPHP4O75161 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NPHP4O75161 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
NPHP4O75161 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NPHP4O75161 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NPHP4O75161 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NPHP4O75161 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NPHP4O75161 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NPHP4O75161 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NPHP4O75161 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NPHP4O75161 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms