Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATP9BO43861 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP9BO43861 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms