Protein–RNA interactions for Protein: O14715

RGPD8, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD8O14715 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RGPD8O14715 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RGPD8O14715 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RGPD8O14715 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RGPD8O14715 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RGPD8O14715 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RGPD8O14715 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RGPD8O14715 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RGPD8O14715 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RGPD8O14715 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RGPD8O14715 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RGPD8O14715 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RGPD8O14715 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RGPD8O14715 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RGPD8O14715 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RGPD8O14715 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RGPD8O14715 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RGPD8O14715 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RGPD8O14715 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RGPD8O14715 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RGPD8O14715 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RGPD8O14715 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RGPD8O14715 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RGPD8O14715 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RGPD8O14715 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RGPD8O14715 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RGPD8O14715 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RGPD8O14715 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RGPD8O14715 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RGPD8O14715 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RGPD8O14715 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RGPD8O14715 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RGPD8O14715 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RGPD8O14715 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RGPD8O14715 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RGPD8O14715 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RGPD8O14715 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RGPD8O14715 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RGPD8O14715 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RGPD8O14715 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RGPD8O14715 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RGPD8O14715 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RGPD8O14715 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RGPD8O14715 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RGPD8O14715 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RGPD8O14715 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RGPD8O14715 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RGPD8O14715 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RGPD8O14715 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RGPD8O14715 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RGPD8O14715 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RGPD8O14715 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RGPD8O14715 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RGPD8O14715 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RGPD8O14715 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RGPD8O14715 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RGPD8O14715 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RGPD8O14715 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RGPD8O14715 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RGPD8O14715 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RGPD8O14715 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RGPD8O14715 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RGPD8O14715 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RGPD8O14715 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RGPD8O14715 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RGPD8O14715 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RGPD8O14715 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RGPD8O14715 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RGPD8O14715 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RGPD8O14715 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RGPD8O14715 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RGPD8O14715 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RGPD8O14715 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RGPD8O14715 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RGPD8O14715 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RGPD8O14715 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RGPD8O14715 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RGPD8O14715 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RGPD8O14715 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RGPD8O14715 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RGPD8O14715 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RGPD8O14715 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RGPD8O14715 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RGPD8O14715 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RGPD8O14715 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RGPD8O14715 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RGPD8O14715 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RGPD8O14715 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RGPD8O14715 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RGPD8O14715 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RGPD8O14715 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RGPD8O14715 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RGPD8O14715 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RGPD8O14715 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RGPD8O14715 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RGPD8O14715 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RGPD8O14715 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RGPD8O14715 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RGPD8O14715 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RGPD8O14715 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms