Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NEDD8-MDP1E9PL57 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms