Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms