Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVV-1B6SEH8 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms