Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GOLGA6BA6NDN3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GOLGA6BA6NDN3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GOLGA6BA6NDN3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GOLGA6BA6NDN3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GOLGA6BA6NDN3 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GOLGA6BA6NDN3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms