Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PALM3A6NDB9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PALM3A6NDB9 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms