Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC144AA2RUR9 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC144AA2RUR9 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC144AA2RUR9 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC144AA2RUR9 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC144AA2RUR9 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC144AA2RUR9 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC144AA2RUR9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC144AA2RUR9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC144AA2RUR9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC144AA2RUR9 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC144AA2RUR9 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC144AA2RUR9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC144AA2RUR9 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC144AA2RUR9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC144AA2RUR9 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC144AA2RUR9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC144AA2RUR9 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC144AA2RUR9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC144AA2RUR9 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC144AA2RUR9 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC144AA2RUR9 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC144AA2RUR9 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC144AA2RUR9 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC144AA2RUR9 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC144AA2RUR9 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC144AA2RUR9 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC144AA2RUR9 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC144AA2RUR9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC144AA2RUR9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC144AA2RUR9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC144AA2RUR9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC144AA2RUR9 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC144AA2RUR9 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC144AA2RUR9 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC144AA2RUR9 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC144AA2RUR9 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC144AA2RUR9 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC144AA2RUR9 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC144AA2RUR9 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC144AA2RUR9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC144AA2RUR9 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC144AA2RUR9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms