Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VarsQ9Z1Q9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VarsQ9Z1Q9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VarsQ9Z1Q9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VarsQ9Z1Q9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VarsQ9Z1Q9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VarsQ9Z1Q9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
VarsQ9Z1Q9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VarsQ9Z1Q9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VarsQ9Z1Q9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
VarsQ9Z1Q9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VarsQ9Z1Q9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VarsQ9Z1Q9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VarsQ9Z1Q9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VarsQ9Z1Q9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VarsQ9Z1Q9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VarsQ9Z1Q9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VarsQ9Z1Q9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VarsQ9Z1Q9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
VarsQ9Z1Q9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VarsQ9Z1Q9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VarsQ9Z1Q9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VarsQ9Z1Q9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
VarsQ9Z1Q9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VarsQ9Z1Q9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VarsQ9Z1Q9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VarsQ9Z1Q9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VarsQ9Z1Q9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VarsQ9Z1Q9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VarsQ9Z1Q9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VarsQ9Z1Q9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VarsQ9Z1Q9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VarsQ9Z1Q9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VarsQ9Z1Q9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VarsQ9Z1Q9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VarsQ9Z1Q9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VarsQ9Z1Q9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
VarsQ9Z1Q9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VarsQ9Z1Q9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
VarsQ9Z1Q9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
VarsQ9Z1Q9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VarsQ9Z1Q9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VarsQ9Z1Q9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VarsQ9Z1Q9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VarsQ9Z1Q9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VarsQ9Z1Q9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VarsQ9Z1Q9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VarsQ9Z1Q9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VarsQ9Z1Q9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VarsQ9Z1Q9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VarsQ9Z1Q9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VarsQ9Z1Q9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VarsQ9Z1Q9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
VarsQ9Z1Q9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VarsQ9Z1Q9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VarsQ9Z1Q9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
VarsQ9Z1Q9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VarsQ9Z1Q9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VarsQ9Z1Q9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VarsQ9Z1Q9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VarsQ9Z1Q9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VarsQ9Z1Q9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VarsQ9Z1Q9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VarsQ9Z1Q9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VarsQ9Z1Q9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VarsQ9Z1Q9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VarsQ9Z1Q9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VarsQ9Z1Q9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VarsQ9Z1Q9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VarsQ9Z1Q9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VarsQ9Z1Q9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VarsQ9Z1Q9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VarsQ9Z1Q9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VarsQ9Z1Q9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
VarsQ9Z1Q9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
VarsQ9Z1Q9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VarsQ9Z1Q9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VarsQ9Z1Q9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VarsQ9Z1Q9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VarsQ9Z1Q9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VarsQ9Z1Q9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VarsQ9Z1Q9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VarsQ9Z1Q9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VarsQ9Z1Q9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VarsQ9Z1Q9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VarsQ9Z1Q9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VarsQ9Z1Q9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VarsQ9Z1Q9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VarsQ9Z1Q9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VarsQ9Z1Q9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VarsQ9Z1Q9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VarsQ9Z1Q9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VarsQ9Z1Q9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VarsQ9Z1Q9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VarsQ9Z1Q9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VarsQ9Z1Q9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VarsQ9Z1Q9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VarsQ9Z1Q9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VarsQ9Z1Q9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VarsQ9Z1Q9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms