Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z185

Padi1, Protein-arginine deiminase type-1, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Padi1Q9Z185 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Padi1Q9Z185 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Padi1Q9Z185 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Padi1Q9Z185 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Padi1Q9Z185 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Padi1Q9Z185 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Padi1Q9Z185 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Padi1Q9Z185 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Padi1Q9Z185 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Padi1Q9Z185 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Padi1Q9Z185 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Padi1Q9Z185 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Padi1Q9Z185 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Padi1Q9Z185 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Padi1Q9Z185 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Padi1Q9Z185 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Padi1Q9Z185 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Padi1Q9Z185 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Padi1Q9Z185 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Padi1Q9Z185 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Padi1Q9Z185 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Padi1Q9Z185 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Padi1Q9Z185 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Padi1Q9Z185 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Padi1Q9Z185 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Padi1Q9Z185 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Padi1Q9Z185 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Padi1Q9Z185 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Padi1Q9Z185 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Padi1Q9Z185 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Padi1Q9Z185 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Padi1Q9Z185 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Padi1Q9Z185 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Padi1Q9Z185 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Padi1Q9Z185 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Padi1Q9Z185 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Padi1Q9Z185 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Padi1Q9Z185 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Padi1Q9Z185 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Padi1Q9Z185 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Padi1Q9Z185 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Padi1Q9Z185 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Padi1Q9Z185 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Padi1Q9Z185 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Padi1Q9Z185 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Padi1Q9Z185 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Padi1Q9Z185 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Padi1Q9Z185 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Padi1Q9Z185 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Padi1Q9Z185 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Padi1Q9Z185 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Padi1Q9Z185 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Padi1Q9Z185 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Padi1Q9Z185 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Padi1Q9Z185 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Padi1Q9Z185 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Padi1Q9Z185 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Padi1Q9Z185 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Padi1Q9Z185 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Padi1Q9Z185 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Padi1Q9Z185 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Padi1Q9Z185 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Padi1Q9Z185 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Padi1Q9Z185 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Padi1Q9Z185 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Padi1Q9Z185 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Padi1Q9Z185 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Padi1Q9Z185 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Padi1Q9Z185 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Padi1Q9Z185 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Padi1Q9Z185 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Padi1Q9Z185 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Padi1Q9Z185 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Padi1Q9Z185 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Padi1Q9Z185 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Padi1Q9Z185 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Padi1Q9Z185 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Padi1Q9Z185 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Padi1Q9Z185 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Padi1Q9Z185 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Padi1Q9Z185 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Padi1Q9Z185 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Padi1Q9Z185 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Padi1Q9Z185 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Padi1Q9Z185 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Padi1Q9Z185 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Padi1Q9Z185 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Padi1Q9Z185 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Padi1Q9Z185 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Padi1Q9Z185 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Padi1Q9Z185 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Padi1Q9Z185 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Padi1Q9Z185 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Padi1Q9Z185 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Padi1Q9Z185 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Padi1Q9Z185 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Padi1Q9Z185 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Padi1Q9Z185 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Padi1Q9Z185 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Padi1Q9Z185 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms