Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0T9

Itgb6, Integrin beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb6Q9Z0T9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itgb6Q9Z0T9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itgb6Q9Z0T9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itgb6Q9Z0T9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itgb6Q9Z0T9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itgb6Q9Z0T9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itgb6Q9Z0T9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itgb6Q9Z0T9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itgb6Q9Z0T9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itgb6Q9Z0T9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itgb6Q9Z0T9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itgb6Q9Z0T9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itgb6Q9Z0T9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itgb6Q9Z0T9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itgb6Q9Z0T9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itgb6Q9Z0T9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itgb6Q9Z0T9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itgb6Q9Z0T9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itgb6Q9Z0T9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itgb6Q9Z0T9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itgb6Q9Z0T9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itgb6Q9Z0T9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itgb6Q9Z0T9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itgb6Q9Z0T9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itgb6Q9Z0T9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itgb6Q9Z0T9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itgb6Q9Z0T9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itgb6Q9Z0T9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itgb6Q9Z0T9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itgb6Q9Z0T9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itgb6Q9Z0T9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itgb6Q9Z0T9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itgb6Q9Z0T9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itgb6Q9Z0T9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itgb6Q9Z0T9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itgb6Q9Z0T9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itgb6Q9Z0T9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itgb6Q9Z0T9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itgb6Q9Z0T9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itgb6Q9Z0T9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itgb6Q9Z0T9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itgb6Q9Z0T9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itgb6Q9Z0T9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itgb6Q9Z0T9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itgb6Q9Z0T9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itgb6Q9Z0T9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itgb6Q9Z0T9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itgb6Q9Z0T9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Itgb6Q9Z0T9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itgb6Q9Z0T9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itgb6Q9Z0T9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itgb6Q9Z0T9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itgb6Q9Z0T9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Itgb6Q9Z0T9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itgb6Q9Z0T9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itgb6Q9Z0T9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itgb6Q9Z0T9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itgb6Q9Z0T9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itgb6Q9Z0T9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itgb6Q9Z0T9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itgb6Q9Z0T9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itgb6Q9Z0T9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itgb6Q9Z0T9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itgb6Q9Z0T9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itgb6Q9Z0T9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itgb6Q9Z0T9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itgb6Q9Z0T9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Itgb6Q9Z0T9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itgb6Q9Z0T9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itgb6Q9Z0T9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itgb6Q9Z0T9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itgb6Q9Z0T9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itgb6Q9Z0T9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Itgb6Q9Z0T9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itgb6Q9Z0T9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itgb6Q9Z0T9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itgb6Q9Z0T9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itgb6Q9Z0T9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itgb6Q9Z0T9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itgb6Q9Z0T9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itgb6Q9Z0T9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itgb6Q9Z0T9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itgb6Q9Z0T9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itgb6Q9Z0T9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itgb6Q9Z0T9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itgb6Q9Z0T9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itgb6Q9Z0T9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itgb6Q9Z0T9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgb6Q9Z0T9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgb6Q9Z0T9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgb6Q9Z0T9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgb6Q9Z0T9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgb6Q9Z0T9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgb6Q9Z0T9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Itgb6Q9Z0T9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itgb6Q9Z0T9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itgb6Q9Z0T9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itgb6Q9Z0T9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itgb6Q9Z0T9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itgb6Q9Z0T9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms