Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trim44Q9QXA7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trim44Q9QXA7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trim44Q9QXA7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trim44Q9QXA7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trim44Q9QXA7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trim44Q9QXA7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trim44Q9QXA7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trim44Q9QXA7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trim44Q9QXA7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trim44Q9QXA7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trim44Q9QXA7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trim44Q9QXA7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trim44Q9QXA7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trim44Q9QXA7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trim44Q9QXA7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Trim44Q9QXA7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trim44Q9QXA7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trim44Q9QXA7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trim44Q9QXA7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trim44Q9QXA7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trim44Q9QXA7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trim44Q9QXA7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trim44Q9QXA7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trim44Q9QXA7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trim44Q9QXA7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trim44Q9QXA7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trim44Q9QXA7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trim44Q9QXA7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trim44Q9QXA7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trim44Q9QXA7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trim44Q9QXA7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trim44Q9QXA7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Trim44Q9QXA7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trim44Q9QXA7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trim44Q9QXA7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Trim44Q9QXA7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trim44Q9QXA7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trim44Q9QXA7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trim44Q9QXA7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trim44Q9QXA7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trim44Q9QXA7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trim44Q9QXA7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trim44Q9QXA7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trim44Q9QXA7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trim44Q9QXA7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trim44Q9QXA7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trim44Q9QXA7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trim44Q9QXA7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trim44Q9QXA7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trim44Q9QXA7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Trim44Q9QXA7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Trim44Q9QXA7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trim44Q9QXA7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trim44Q9QXA7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trim44Q9QXA7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trim44Q9QXA7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trim44Q9QXA7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trim44Q9QXA7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trim44Q9QXA7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Trim44Q9QXA7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trim44Q9QXA7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trim44Q9QXA7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trim44Q9QXA7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trim44Q9QXA7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trim44Q9QXA7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trim44Q9QXA7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trim44Q9QXA7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trim44Q9QXA7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trim44Q9QXA7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trim44Q9QXA7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trim44Q9QXA7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trim44Q9QXA7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Trim44Q9QXA7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trim44Q9QXA7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trim44Q9QXA7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trim44Q9QXA7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trim44Q9QXA7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trim44Q9QXA7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trim44Q9QXA7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trim44Q9QXA7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trim44Q9QXA7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trim44Q9QXA7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trim44Q9QXA7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trim44Q9QXA7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trim44Q9QXA7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trim44Q9QXA7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trim44Q9QXA7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trim44Q9QXA7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trim44Q9QXA7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trim44Q9QXA7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trim44Q9QXA7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trim44Q9QXA7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trim44Q9QXA7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trim44Q9QXA7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trim44Q9QXA7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trim44Q9QXA7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trim44Q9QXA7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trim44Q9QXA7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trim44Q9QXA7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms