Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ59

Abcb9, ATP-binding cassette sub-family B member 9, mousemouse

Predictions only

Length 762 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb9Q9JJ59 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Abcb9Q9JJ59 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcb9Q9JJ59 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcb9Q9JJ59 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcb9Q9JJ59 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Abcb9Q9JJ59 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcb9Q9JJ59 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcb9Q9JJ59 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcb9Q9JJ59 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcb9Q9JJ59 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcb9Q9JJ59 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcb9Q9JJ59 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcb9Q9JJ59 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcb9Q9JJ59 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcb9Q9JJ59 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcb9Q9JJ59 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcb9Q9JJ59 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcb9Q9JJ59 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcb9Q9JJ59 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcb9Q9JJ59 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcb9Q9JJ59 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcb9Q9JJ59 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Abcb9Q9JJ59 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Abcb9Q9JJ59 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcb9Q9JJ59 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcb9Q9JJ59 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcb9Q9JJ59 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcb9Q9JJ59 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcb9Q9JJ59 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcb9Q9JJ59 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcb9Q9JJ59 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcb9Q9JJ59 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcb9Q9JJ59 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcb9Q9JJ59 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcb9Q9JJ59 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcb9Q9JJ59 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcb9Q9JJ59 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcb9Q9JJ59 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcb9Q9JJ59 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcb9Q9JJ59 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcb9Q9JJ59 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcb9Q9JJ59 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcb9Q9JJ59 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcb9Q9JJ59 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcb9Q9JJ59 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcb9Q9JJ59 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcb9Q9JJ59 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcb9Q9JJ59 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcb9Q9JJ59 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcb9Q9JJ59 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcb9Q9JJ59 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcb9Q9JJ59 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcb9Q9JJ59 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcb9Q9JJ59 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcb9Q9JJ59 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcb9Q9JJ59 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcb9Q9JJ59 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcb9Q9JJ59 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcb9Q9JJ59 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcb9Q9JJ59 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcb9Q9JJ59 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcb9Q9JJ59 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcb9Q9JJ59 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcb9Q9JJ59 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcb9Q9JJ59 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abcb9Q9JJ59 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcb9Q9JJ59 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcb9Q9JJ59 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcb9Q9JJ59 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcb9Q9JJ59 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abcb9Q9JJ59 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcb9Q9JJ59 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abcb9Q9JJ59 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcb9Q9JJ59 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcb9Q9JJ59 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcb9Q9JJ59 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcb9Q9JJ59 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcb9Q9JJ59 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcb9Q9JJ59 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcb9Q9JJ59 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcb9Q9JJ59 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcb9Q9JJ59 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcb9Q9JJ59 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcb9Q9JJ59 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcb9Q9JJ59 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcb9Q9JJ59 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcb9Q9JJ59 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcb9Q9JJ59 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcb9Q9JJ59 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcb9Q9JJ59 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcb9Q9JJ59 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcb9Q9JJ59 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcb9Q9JJ59 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcb9Q9JJ59 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcb9Q9JJ59 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcb9Q9JJ59 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcb9Q9JJ59 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcb9Q9JJ59 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcb9Q9JJ59 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcb9Q9JJ59 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.3 ms