Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smad9Q9JIW5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smad9Q9JIW5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smad9Q9JIW5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smad9Q9JIW5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smad9Q9JIW5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smad9Q9JIW5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smad9Q9JIW5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smad9Q9JIW5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smad9Q9JIW5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Smad9Q9JIW5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smad9Q9JIW5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smad9Q9JIW5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smad9Q9JIW5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Smad9Q9JIW5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smad9Q9JIW5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smad9Q9JIW5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smad9Q9JIW5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smad9Q9JIW5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smad9Q9JIW5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Smad9Q9JIW5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smad9Q9JIW5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smad9Q9JIW5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smad9Q9JIW5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smad9Q9JIW5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smad9Q9JIW5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smad9Q9JIW5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smad9Q9JIW5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smad9Q9JIW5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Smad9Q9JIW5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smad9Q9JIW5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smad9Q9JIW5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smad9Q9JIW5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Smad9Q9JIW5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smad9Q9JIW5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smad9Q9JIW5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smad9Q9JIW5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smad9Q9JIW5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smad9Q9JIW5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smad9Q9JIW5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smad9Q9JIW5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smad9Q9JIW5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smad9Q9JIW5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smad9Q9JIW5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smad9Q9JIW5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smad9Q9JIW5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smad9Q9JIW5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smad9Q9JIW5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smad9Q9JIW5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smad9Q9JIW5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smad9Q9JIW5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smad9Q9JIW5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smad9Q9JIW5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smad9Q9JIW5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smad9Q9JIW5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smad9Q9JIW5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smad9Q9JIW5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smad9Q9JIW5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smad9Q9JIW5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smad9Q9JIW5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smad9Q9JIW5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smad9Q9JIW5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smad9Q9JIW5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Smad9Q9JIW5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smad9Q9JIW5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smad9Q9JIW5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Smad9Q9JIW5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smad9Q9JIW5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smad9Q9JIW5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smad9Q9JIW5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smad9Q9JIW5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smad9Q9JIW5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smad9Q9JIW5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smad9Q9JIW5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smad9Q9JIW5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smad9Q9JIW5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smad9Q9JIW5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smad9Q9JIW5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smad9Q9JIW5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smad9Q9JIW5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smad9Q9JIW5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smad9Q9JIW5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smad9Q9JIW5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smad9Q9JIW5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smad9Q9JIW5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smad9Q9JIW5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smad9Q9JIW5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smad9Q9JIW5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smad9Q9JIW5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smad9Q9JIW5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smad9Q9JIW5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smad9Q9JIW5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smad9Q9JIW5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smad9Q9JIW5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smad9Q9JIW5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Smad9Q9JIW5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Smad9Q9JIW5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smad9Q9JIW5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smad9Q9JIW5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smad9Q9JIW5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms