Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ5

Htr3b, 5-hydroxytryptamine receptor 3B, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr3bQ9JHJ5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Htr3bQ9JHJ5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Htr3bQ9JHJ5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Htr3bQ9JHJ5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Htr3bQ9JHJ5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Htr3bQ9JHJ5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Htr3bQ9JHJ5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Htr3bQ9JHJ5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Htr3bQ9JHJ5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Htr3bQ9JHJ5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Htr3bQ9JHJ5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Htr3bQ9JHJ5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Htr3bQ9JHJ5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Htr3bQ9JHJ5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Htr3bQ9JHJ5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Htr3bQ9JHJ5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Htr3bQ9JHJ5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Htr3bQ9JHJ5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Htr3bQ9JHJ5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Htr3bQ9JHJ5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Htr3bQ9JHJ5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Htr3bQ9JHJ5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Htr3bQ9JHJ5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Htr3bQ9JHJ5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Htr3bQ9JHJ5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Htr3bQ9JHJ5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Htr3bQ9JHJ5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Htr3bQ9JHJ5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Htr3bQ9JHJ5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Htr3bQ9JHJ5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Htr3bQ9JHJ5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Htr3bQ9JHJ5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Htr3bQ9JHJ5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Htr3bQ9JHJ5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Htr3bQ9JHJ5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Htr3bQ9JHJ5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Htr3bQ9JHJ5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Htr3bQ9JHJ5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Htr3bQ9JHJ5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Htr3bQ9JHJ5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Htr3bQ9JHJ5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Htr3bQ9JHJ5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Htr3bQ9JHJ5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Htr3bQ9JHJ5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Htr3bQ9JHJ5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Htr3bQ9JHJ5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Htr3bQ9JHJ5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Htr3bQ9JHJ5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Htr3bQ9JHJ5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Htr3bQ9JHJ5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Htr3bQ9JHJ5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Htr3bQ9JHJ5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Htr3bQ9JHJ5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Htr3bQ9JHJ5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Htr3bQ9JHJ5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Htr3bQ9JHJ5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Htr3bQ9JHJ5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Htr3bQ9JHJ5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Htr3bQ9JHJ5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Htr3bQ9JHJ5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Htr3bQ9JHJ5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Htr3bQ9JHJ5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Htr3bQ9JHJ5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Htr3bQ9JHJ5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Htr3bQ9JHJ5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Htr3bQ9JHJ5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Htr3bQ9JHJ5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Htr3bQ9JHJ5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Htr3bQ9JHJ5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Htr3bQ9JHJ5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Htr3bQ9JHJ5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Htr3bQ9JHJ5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Htr3bQ9JHJ5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Htr3bQ9JHJ5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Htr3bQ9JHJ5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Htr3bQ9JHJ5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Htr3bQ9JHJ5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Htr3bQ9JHJ5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Htr3bQ9JHJ5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Htr3bQ9JHJ5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Htr3bQ9JHJ5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Htr3bQ9JHJ5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Htr3bQ9JHJ5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Htr3bQ9JHJ5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Htr3bQ9JHJ5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Htr3bQ9JHJ5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Htr3bQ9JHJ5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Htr3bQ9JHJ5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Htr3bQ9JHJ5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Htr3bQ9JHJ5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Htr3bQ9JHJ5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Htr3bQ9JHJ5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Htr3bQ9JHJ5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Htr3bQ9JHJ5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Htr3bQ9JHJ5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Htr3bQ9JHJ5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Htr3bQ9JHJ5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Htr3bQ9JHJ5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Htr3bQ9JHJ5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Htr3bQ9JHJ5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms