Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB5

Slco1c1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco1c1Q9ERB5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slco1c1Q9ERB5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slco1c1Q9ERB5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slco1c1Q9ERB5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slco1c1Q9ERB5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Slco1c1Q9ERB5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slco1c1Q9ERB5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slco1c1Q9ERB5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slco1c1Q9ERB5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slco1c1Q9ERB5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slco1c1Q9ERB5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slco1c1Q9ERB5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slco1c1Q9ERB5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slco1c1Q9ERB5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slco1c1Q9ERB5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slco1c1Q9ERB5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slco1c1Q9ERB5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slco1c1Q9ERB5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slco1c1Q9ERB5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slco1c1Q9ERB5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slco1c1Q9ERB5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slco1c1Q9ERB5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slco1c1Q9ERB5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slco1c1Q9ERB5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slco1c1Q9ERB5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slco1c1Q9ERB5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slco1c1Q9ERB5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slco1c1Q9ERB5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slco1c1Q9ERB5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slco1c1Q9ERB5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slco1c1Q9ERB5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slco1c1Q9ERB5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Slco1c1Q9ERB5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Slco1c1Q9ERB5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slco1c1Q9ERB5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slco1c1Q9ERB5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slco1c1Q9ERB5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slco1c1Q9ERB5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Slco1c1Q9ERB5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slco1c1Q9ERB5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slco1c1Q9ERB5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slco1c1Q9ERB5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slco1c1Q9ERB5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slco1c1Q9ERB5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slco1c1Q9ERB5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slco1c1Q9ERB5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slco1c1Q9ERB5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slco1c1Q9ERB5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Slco1c1Q9ERB5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slco1c1Q9ERB5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slco1c1Q9ERB5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slco1c1Q9ERB5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Slco1c1Q9ERB5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slco1c1Q9ERB5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slco1c1Q9ERB5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slco1c1Q9ERB5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slco1c1Q9ERB5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slco1c1Q9ERB5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slco1c1Q9ERB5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slco1c1Q9ERB5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slco1c1Q9ERB5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slco1c1Q9ERB5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slco1c1Q9ERB5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slco1c1Q9ERB5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slco1c1Q9ERB5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slco1c1Q9ERB5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slco1c1Q9ERB5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slco1c1Q9ERB5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slco1c1Q9ERB5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Slco1c1Q9ERB5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slco1c1Q9ERB5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slco1c1Q9ERB5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slco1c1Q9ERB5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slco1c1Q9ERB5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slco1c1Q9ERB5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slco1c1Q9ERB5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slco1c1Q9ERB5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slco1c1Q9ERB5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Slco1c1Q9ERB5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slco1c1Q9ERB5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Slco1c1Q9ERB5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slco1c1Q9ERB5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slco1c1Q9ERB5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slco1c1Q9ERB5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slco1c1Q9ERB5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slco1c1Q9ERB5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slco1c1Q9ERB5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slco1c1Q9ERB5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slco1c1Q9ERB5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slco1c1Q9ERB5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slco1c1Q9ERB5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slco1c1Q9ERB5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slco1c1Q9ERB5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slco1c1Q9ERB5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slco1c1Q9ERB5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slco1c1Q9ERB5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slco1c1Q9ERB5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slco1c1Q9ERB5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slco1c1Q9ERB5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slco1c1Q9ERB5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms