Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQJ0

Tpcn1, Two pore calcium channel protein 1, mousemouse

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Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpcn1Q9EQJ0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tpcn1Q9EQJ0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tpcn1Q9EQJ0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tpcn1Q9EQJ0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Tpcn1Q9EQJ0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tpcn1Q9EQJ0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tpcn1Q9EQJ0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tpcn1Q9EQJ0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tpcn1Q9EQJ0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tpcn1Q9EQJ0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tpcn1Q9EQJ0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tpcn1Q9EQJ0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tpcn1Q9EQJ0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tpcn1Q9EQJ0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tpcn1Q9EQJ0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tpcn1Q9EQJ0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tpcn1Q9EQJ0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tpcn1Q9EQJ0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tpcn1Q9EQJ0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Tpcn1Q9EQJ0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tpcn1Q9EQJ0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tpcn1Q9EQJ0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tpcn1Q9EQJ0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tpcn1Q9EQJ0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tpcn1Q9EQJ0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tpcn1Q9EQJ0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tpcn1Q9EQJ0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tpcn1Q9EQJ0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tpcn1Q9EQJ0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tpcn1Q9EQJ0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tpcn1Q9EQJ0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tpcn1Q9EQJ0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tpcn1Q9EQJ0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tpcn1Q9EQJ0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tpcn1Q9EQJ0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tpcn1Q9EQJ0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tpcn1Q9EQJ0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tpcn1Q9EQJ0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Tpcn1Q9EQJ0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tpcn1Q9EQJ0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tpcn1Q9EQJ0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tpcn1Q9EQJ0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tpcn1Q9EQJ0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tpcn1Q9EQJ0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Tpcn1Q9EQJ0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tpcn1Q9EQJ0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tpcn1Q9EQJ0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tpcn1Q9EQJ0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tpcn1Q9EQJ0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tpcn1Q9EQJ0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tpcn1Q9EQJ0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tpcn1Q9EQJ0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tpcn1Q9EQJ0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Tpcn1Q9EQJ0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tpcn1Q9EQJ0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tpcn1Q9EQJ0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tpcn1Q9EQJ0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tpcn1Q9EQJ0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tpcn1Q9EQJ0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tpcn1Q9EQJ0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tpcn1Q9EQJ0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tpcn1Q9EQJ0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tpcn1Q9EQJ0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tpcn1Q9EQJ0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tpcn1Q9EQJ0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tpcn1Q9EQJ0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tpcn1Q9EQJ0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tpcn1Q9EQJ0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tpcn1Q9EQJ0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tpcn1Q9EQJ0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tpcn1Q9EQJ0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tpcn1Q9EQJ0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tpcn1Q9EQJ0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tpcn1Q9EQJ0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tpcn1Q9EQJ0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Tpcn1Q9EQJ0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tpcn1Q9EQJ0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tpcn1Q9EQJ0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tpcn1Q9EQJ0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tpcn1Q9EQJ0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tpcn1Q9EQJ0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tpcn1Q9EQJ0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tpcn1Q9EQJ0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tpcn1Q9EQJ0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tpcn1Q9EQJ0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tpcn1Q9EQJ0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tpcn1Q9EQJ0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tpcn1Q9EQJ0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tpcn1Q9EQJ0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tpcn1Q9EQJ0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tpcn1Q9EQJ0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tpcn1Q9EQJ0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tpcn1Q9EQJ0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tpcn1Q9EQJ0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tpcn1Q9EQJ0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tpcn1Q9EQJ0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tpcn1Q9EQJ0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tpcn1Q9EQJ0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tpcn1Q9EQJ0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tpcn1Q9EQJ0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
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