Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCZ9

Aph1c, Putative gamma-secretase subunit APH-1C, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1cQ9DCZ9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aph1cQ9DCZ9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aph1cQ9DCZ9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aph1cQ9DCZ9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aph1cQ9DCZ9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aph1cQ9DCZ9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aph1cQ9DCZ9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aph1cQ9DCZ9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aph1cQ9DCZ9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Aph1cQ9DCZ9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Aph1cQ9DCZ9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Aph1cQ9DCZ9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Aph1cQ9DCZ9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Aph1cQ9DCZ9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Aph1cQ9DCZ9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Aph1cQ9DCZ9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Aph1cQ9DCZ9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Aph1cQ9DCZ9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Aph1cQ9DCZ9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Aph1cQ9DCZ9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Aph1cQ9DCZ9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Aph1cQ9DCZ9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Aph1cQ9DCZ9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Aph1cQ9DCZ9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Aph1cQ9DCZ9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Aph1cQ9DCZ9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Aph1cQ9DCZ9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Aph1cQ9DCZ9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Aph1cQ9DCZ9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aph1cQ9DCZ9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aph1cQ9DCZ9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Aph1cQ9DCZ9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aph1cQ9DCZ9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Aph1cQ9DCZ9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Aph1cQ9DCZ9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Aph1cQ9DCZ9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Aph1cQ9DCZ9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Aph1cQ9DCZ9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Aph1cQ9DCZ9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Aph1cQ9DCZ9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Aph1cQ9DCZ9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Aph1cQ9DCZ9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Aph1cQ9DCZ9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Aph1cQ9DCZ9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Aph1cQ9DCZ9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Aph1cQ9DCZ9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Aph1cQ9DCZ9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Aph1cQ9DCZ9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Aph1cQ9DCZ9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Aph1cQ9DCZ9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Aph1cQ9DCZ9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Aph1cQ9DCZ9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Aph1cQ9DCZ9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Aph1cQ9DCZ9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Aph1cQ9DCZ9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Aph1cQ9DCZ9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Aph1cQ9DCZ9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Aph1cQ9DCZ9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Aph1cQ9DCZ9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Aph1cQ9DCZ9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Aph1cQ9DCZ9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Aph1cQ9DCZ9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Aph1cQ9DCZ9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Aph1cQ9DCZ9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Aph1cQ9DCZ9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Aph1cQ9DCZ9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Aph1cQ9DCZ9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Aph1cQ9DCZ9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Aph1cQ9DCZ9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Aph1cQ9DCZ9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Aph1cQ9DCZ9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Aph1cQ9DCZ9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Aph1cQ9DCZ9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Aph1cQ9DCZ9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Aph1cQ9DCZ9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Aph1cQ9DCZ9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Aph1cQ9DCZ9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Aph1cQ9DCZ9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Aph1cQ9DCZ9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Aph1cQ9DCZ9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Aph1cQ9DCZ9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Aph1cQ9DCZ9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Aph1cQ9DCZ9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Aph1cQ9DCZ9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Aph1cQ9DCZ9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Aph1cQ9DCZ9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Aph1cQ9DCZ9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Aph1cQ9DCZ9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Aph1cQ9DCZ9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Aph1cQ9DCZ9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Aph1cQ9DCZ9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Aph1cQ9DCZ9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Aph1cQ9DCZ9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Aph1cQ9DCZ9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Aph1cQ9DCZ9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Aph1cQ9DCZ9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Aph1cQ9DCZ9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Aph1cQ9DCZ9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Aph1cQ9DCZ9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Aph1cQ9DCZ9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms