Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8V0

Hm13, Minor histocompatibility antigen H13, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hm13Q9D8V0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hm13Q9D8V0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hm13Q9D8V0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hm13Q9D8V0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hm13Q9D8V0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hm13Q9D8V0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hm13Q9D8V0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hm13Q9D8V0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hm13Q9D8V0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hm13Q9D8V0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hm13Q9D8V0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hm13Q9D8V0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hm13Q9D8V0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hm13Q9D8V0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hm13Q9D8V0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hm13Q9D8V0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hm13Q9D8V0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hm13Q9D8V0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hm13Q9D8V0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hm13Q9D8V0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hm13Q9D8V0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hm13Q9D8V0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hm13Q9D8V0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hm13Q9D8V0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hm13Q9D8V0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hm13Q9D8V0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hm13Q9D8V0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hm13Q9D8V0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hm13Q9D8V0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hm13Q9D8V0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hm13Q9D8V0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hm13Q9D8V0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hm13Q9D8V0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hm13Q9D8V0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hm13Q9D8V0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hm13Q9D8V0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hm13Q9D8V0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hm13Q9D8V0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hm13Q9D8V0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hm13Q9D8V0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hm13Q9D8V0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hm13Q9D8V0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hm13Q9D8V0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hm13Q9D8V0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hm13Q9D8V0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hm13Q9D8V0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hm13Q9D8V0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hm13Q9D8V0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hm13Q9D8V0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hm13Q9D8V0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hm13Q9D8V0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hm13Q9D8V0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hm13Q9D8V0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hm13Q9D8V0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hm13Q9D8V0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hm13Q9D8V0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hm13Q9D8V0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hm13Q9D8V0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hm13Q9D8V0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hm13Q9D8V0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hm13Q9D8V0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hm13Q9D8V0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hm13Q9D8V0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hm13Q9D8V0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hm13Q9D8V0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hm13Q9D8V0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hm13Q9D8V0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hm13Q9D8V0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hm13Q9D8V0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hm13Q9D8V0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hm13Q9D8V0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hm13Q9D8V0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hm13Q9D8V0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hm13Q9D8V0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hm13Q9D8V0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hm13Q9D8V0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hm13Q9D8V0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hm13Q9D8V0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hm13Q9D8V0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hm13Q9D8V0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hm13Q9D8V0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hm13Q9D8V0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hm13Q9D8V0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hm13Q9D8V0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hm13Q9D8V0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hm13Q9D8V0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hm13Q9D8V0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hm13Q9D8V0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hm13Q9D8V0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hm13Q9D8V0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hm13Q9D8V0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hm13Q9D8V0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hm13Q9D8V0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hm13Q9D8V0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hm13Q9D8V0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hm13Q9D8V0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hm13Q9D8V0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hm13Q9D8V0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hm13Q9D8V0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hm13Q9D8V0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms