Protein–RNA interactions for Protein: Q9D496

4930548H24Rik, RIKEN cDNA 4930548H24, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930548H24RikQ9D496 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
4930548H24RikQ9D496 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
4930548H24RikQ9D496 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
4930548H24RikQ9D496 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
4930548H24RikQ9D496 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
4930548H24RikQ9D496 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
4930548H24RikQ9D496 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
4930548H24RikQ9D496 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
4930548H24RikQ9D496 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
4930548H24RikQ9D496 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
4930548H24RikQ9D496 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
4930548H24RikQ9D496 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
4930548H24RikQ9D496 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
4930548H24RikQ9D496 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
4930548H24RikQ9D496 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
4930548H24RikQ9D496 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
4930548H24RikQ9D496 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
4930548H24RikQ9D496 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
4930548H24RikQ9D496 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
4930548H24RikQ9D496 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
4930548H24RikQ9D496 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
4930548H24RikQ9D496 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
4930548H24RikQ9D496 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
4930548H24RikQ9D496 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
4930548H24RikQ9D496 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
4930548H24RikQ9D496 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
4930548H24RikQ9D496 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
4930548H24RikQ9D496 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
4930548H24RikQ9D496 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
4930548H24RikQ9D496 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
4930548H24RikQ9D496 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
4930548H24RikQ9D496 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
4930548H24RikQ9D496 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
4930548H24RikQ9D496 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
4930548H24RikQ9D496 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
4930548H24RikQ9D496 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
4930548H24RikQ9D496 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
4930548H24RikQ9D496 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
4930548H24RikQ9D496 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
4930548H24RikQ9D496 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
4930548H24RikQ9D496 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
4930548H24RikQ9D496 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
4930548H24RikQ9D496 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
4930548H24RikQ9D496 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
4930548H24RikQ9D496 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
4930548H24RikQ9D496 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
4930548H24RikQ9D496 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
4930548H24RikQ9D496 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
4930548H24RikQ9D496 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
4930548H24RikQ9D496 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
4930548H24RikQ9D496 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
4930548H24RikQ9D496 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
4930548H24RikQ9D496 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
4930548H24RikQ9D496 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
4930548H24RikQ9D496 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
4930548H24RikQ9D496 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
4930548H24RikQ9D496 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
4930548H24RikQ9D496 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
4930548H24RikQ9D496 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
4930548H24RikQ9D496 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
4930548H24RikQ9D496 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
4930548H24RikQ9D496 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
4930548H24RikQ9D496 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
4930548H24RikQ9D496 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
4930548H24RikQ9D496 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
4930548H24RikQ9D496 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
4930548H24RikQ9D496 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
4930548H24RikQ9D496 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
4930548H24RikQ9D496 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
4930548H24RikQ9D496 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
4930548H24RikQ9D496 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
4930548H24RikQ9D496 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
4930548H24RikQ9D496 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
4930548H24RikQ9D496 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
4930548H24RikQ9D496 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
4930548H24RikQ9D496 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
4930548H24RikQ9D496 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
4930548H24RikQ9D496 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
4930548H24RikQ9D496 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
4930548H24RikQ9D496 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
4930548H24RikQ9D496 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
4930548H24RikQ9D496 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
4930548H24RikQ9D496 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
4930548H24RikQ9D496 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
4930548H24RikQ9D496 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
4930548H24RikQ9D496 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
4930548H24RikQ9D496 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
4930548H24RikQ9D496 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
4930548H24RikQ9D496 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
4930548H24RikQ9D496 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
4930548H24RikQ9D496 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
4930548H24RikQ9D496 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
4930548H24RikQ9D496 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
4930548H24RikQ9D496 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
4930548H24RikQ9D496 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
4930548H24RikQ9D496 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
4930548H24RikQ9D496 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
4930548H24RikQ9D496 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
4930548H24RikQ9D496 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
4930548H24RikQ9D496 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms