Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0U9

Arv1, Protein ARV1, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arv1Q9D0U9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arv1Q9D0U9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arv1Q9D0U9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arv1Q9D0U9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arv1Q9D0U9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arv1Q9D0U9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arv1Q9D0U9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arv1Q9D0U9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arv1Q9D0U9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arv1Q9D0U9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arv1Q9D0U9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Arv1Q9D0U9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arv1Q9D0U9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arv1Q9D0U9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arv1Q9D0U9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arv1Q9D0U9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arv1Q9D0U9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Arv1Q9D0U9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arv1Q9D0U9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arv1Q9D0U9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Arv1Q9D0U9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arv1Q9D0U9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arv1Q9D0U9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arv1Q9D0U9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arv1Q9D0U9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arv1Q9D0U9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arv1Q9D0U9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arv1Q9D0U9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arv1Q9D0U9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arv1Q9D0U9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arv1Q9D0U9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arv1Q9D0U9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arv1Q9D0U9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arv1Q9D0U9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arv1Q9D0U9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arv1Q9D0U9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arv1Q9D0U9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arv1Q9D0U9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arv1Q9D0U9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arv1Q9D0U9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Arv1Q9D0U9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Arv1Q9D0U9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arv1Q9D0U9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arv1Q9D0U9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arv1Q9D0U9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arv1Q9D0U9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arv1Q9D0U9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arv1Q9D0U9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arv1Q9D0U9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arv1Q9D0U9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arv1Q9D0U9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arv1Q9D0U9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arv1Q9D0U9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arv1Q9D0U9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arv1Q9D0U9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arv1Q9D0U9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arv1Q9D0U9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arv1Q9D0U9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arv1Q9D0U9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arv1Q9D0U9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arv1Q9D0U9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arv1Q9D0U9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arv1Q9D0U9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arv1Q9D0U9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arv1Q9D0U9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arv1Q9D0U9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arv1Q9D0U9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arv1Q9D0U9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arv1Q9D0U9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Arv1Q9D0U9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Arv1Q9D0U9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Arv1Q9D0U9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Arv1Q9D0U9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Arv1Q9D0U9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Arv1Q9D0U9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Arv1Q9D0U9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Arv1Q9D0U9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Arv1Q9D0U9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Arv1Q9D0U9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Arv1Q9D0U9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Arv1Q9D0U9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Arv1Q9D0U9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Arv1Q9D0U9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Arv1Q9D0U9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Arv1Q9D0U9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Arv1Q9D0U9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Arv1Q9D0U9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Arv1Q9D0U9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Arv1Q9D0U9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Arv1Q9D0U9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Arv1Q9D0U9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Arv1Q9D0U9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Arv1Q9D0U9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Arv1Q9D0U9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Arv1Q9D0U9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Arv1Q9D0U9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Arv1Q9D0U9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Arv1Q9D0U9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Arv1Q9D0U9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Arv1Q9D0U9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.7 ms