Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tdrd12Q9CWU0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tdrd12Q9CWU0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tdrd12Q9CWU0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tdrd12Q9CWU0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tdrd12Q9CWU0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tdrd12Q9CWU0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tdrd12Q9CWU0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Tdrd12Q9CWU0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tdrd12Q9CWU0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tdrd12Q9CWU0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tdrd12Q9CWU0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tdrd12Q9CWU0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tdrd12Q9CWU0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tdrd12Q9CWU0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tdrd12Q9CWU0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tdrd12Q9CWU0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tdrd12Q9CWU0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tdrd12Q9CWU0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Tdrd12Q9CWU0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tdrd12Q9CWU0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tdrd12Q9CWU0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tdrd12Q9CWU0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tdrd12Q9CWU0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tdrd12Q9CWU0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tdrd12Q9CWU0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tdrd12Q9CWU0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tdrd12Q9CWU0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tdrd12Q9CWU0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Tdrd12Q9CWU0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tdrd12Q9CWU0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tdrd12Q9CWU0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tdrd12Q9CWU0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tdrd12Q9CWU0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tdrd12Q9CWU0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tdrd12Q9CWU0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tdrd12Q9CWU0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Tdrd12Q9CWU0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tdrd12Q9CWU0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tdrd12Q9CWU0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tdrd12Q9CWU0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tdrd12Q9CWU0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tdrd12Q9CWU0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tdrd12Q9CWU0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tdrd12Q9CWU0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tdrd12Q9CWU0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tdrd12Q9CWU0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tdrd12Q9CWU0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tdrd12Q9CWU0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tdrd12Q9CWU0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tdrd12Q9CWU0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tdrd12Q9CWU0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Tdrd12Q9CWU0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tdrd12Q9CWU0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tdrd12Q9CWU0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tdrd12Q9CWU0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tdrd12Q9CWU0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Tdrd12Q9CWU0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tdrd12Q9CWU0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tdrd12Q9CWU0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tdrd12Q9CWU0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Tdrd12Q9CWU0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tdrd12Q9CWU0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tdrd12Q9CWU0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tdrd12Q9CWU0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tdrd12Q9CWU0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tdrd12Q9CWU0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tdrd12Q9CWU0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tdrd12Q9CWU0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tdrd12Q9CWU0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tdrd12Q9CWU0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tdrd12Q9CWU0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tdrd12Q9CWU0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tdrd12Q9CWU0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tdrd12Q9CWU0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Tdrd12Q9CWU0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tdrd12Q9CWU0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tdrd12Q9CWU0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tdrd12Q9CWU0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tdrd12Q9CWU0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tdrd12Q9CWU0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tdrd12Q9CWU0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tdrd12Q9CWU0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tdrd12Q9CWU0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tdrd12Q9CWU0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tdrd12Q9CWU0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tdrd12Q9CWU0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tdrd12Q9CWU0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tdrd12Q9CWU0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tdrd12Q9CWU0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tdrd12Q9CWU0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tdrd12Q9CWU0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Tdrd12Q9CWU0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tdrd12Q9CWU0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tdrd12Q9CWU0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tdrd12Q9CWU0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tdrd12Q9CWU0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tdrd12Q9CWU0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tdrd12Q9CWU0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tdrd12Q9CWU0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms