Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smurf1Q9CUN6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smurf1Q9CUN6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smurf1Q9CUN6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smurf1Q9CUN6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smurf1Q9CUN6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smurf1Q9CUN6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smurf1Q9CUN6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smurf1Q9CUN6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smurf1Q9CUN6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smurf1Q9CUN6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smurf1Q9CUN6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smurf1Q9CUN6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smurf1Q9CUN6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smurf1Q9CUN6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smurf1Q9CUN6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smurf1Q9CUN6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smurf1Q9CUN6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smurf1Q9CUN6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smurf1Q9CUN6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smurf1Q9CUN6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smurf1Q9CUN6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smurf1Q9CUN6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smurf1Q9CUN6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smurf1Q9CUN6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smurf1Q9CUN6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smurf1Q9CUN6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smurf1Q9CUN6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smurf1Q9CUN6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smurf1Q9CUN6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smurf1Q9CUN6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smurf1Q9CUN6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smurf1Q9CUN6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smurf1Q9CUN6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Smurf1Q9CUN6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smurf1Q9CUN6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smurf1Q9CUN6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smurf1Q9CUN6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smurf1Q9CUN6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Smurf1Q9CUN6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smurf1Q9CUN6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smurf1Q9CUN6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smurf1Q9CUN6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smurf1Q9CUN6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smurf1Q9CUN6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smurf1Q9CUN6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smurf1Q9CUN6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smurf1Q9CUN6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smurf1Q9CUN6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smurf1Q9CUN6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smurf1Q9CUN6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smurf1Q9CUN6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smurf1Q9CUN6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smurf1Q9CUN6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smurf1Q9CUN6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smurf1Q9CUN6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smurf1Q9CUN6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smurf1Q9CUN6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smurf1Q9CUN6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smurf1Q9CUN6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smurf1Q9CUN6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smurf1Q9CUN6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smurf1Q9CUN6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smurf1Q9CUN6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smurf1Q9CUN6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smurf1Q9CUN6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smurf1Q9CUN6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smurf1Q9CUN6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smurf1Q9CUN6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smurf1Q9CUN6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smurf1Q9CUN6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smurf1Q9CUN6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smurf1Q9CUN6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smurf1Q9CUN6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smurf1Q9CUN6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smurf1Q9CUN6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smurf1Q9CUN6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smurf1Q9CUN6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smurf1Q9CUN6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smurf1Q9CUN6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smurf1Q9CUN6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smurf1Q9CUN6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smurf1Q9CUN6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smurf1Q9CUN6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smurf1Q9CUN6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smurf1Q9CUN6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smurf1Q9CUN6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smurf1Q9CUN6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smurf1Q9CUN6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smurf1Q9CUN6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smurf1Q9CUN6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smurf1Q9CUN6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smurf1Q9CUN6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smurf1Q9CUN6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Smurf1Q9CUN6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smurf1Q9CUN6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smurf1Q9CUN6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smurf1Q9CUN6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smurf1Q9CUN6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Smurf1Q9CUN6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms