Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE6

Asf1a, Histone chaperone ASF1A, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asf1aQ9CQE6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Asf1aQ9CQE6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Asf1aQ9CQE6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Asf1aQ9CQE6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Asf1aQ9CQE6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Asf1aQ9CQE6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Asf1aQ9CQE6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Asf1aQ9CQE6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Asf1aQ9CQE6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Asf1aQ9CQE6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Asf1aQ9CQE6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Asf1aQ9CQE6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Asf1aQ9CQE6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Asf1aQ9CQE6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Asf1aQ9CQE6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Asf1aQ9CQE6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Asf1aQ9CQE6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Asf1aQ9CQE6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Asf1aQ9CQE6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Asf1aQ9CQE6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Asf1aQ9CQE6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Asf1aQ9CQE6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Asf1aQ9CQE6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Asf1aQ9CQE6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Asf1aQ9CQE6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Asf1aQ9CQE6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Asf1aQ9CQE6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Asf1aQ9CQE6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Asf1aQ9CQE6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Asf1aQ9CQE6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Asf1aQ9CQE6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Asf1aQ9CQE6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Asf1aQ9CQE6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Asf1aQ9CQE6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Asf1aQ9CQE6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Asf1aQ9CQE6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Asf1aQ9CQE6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Asf1aQ9CQE6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Asf1aQ9CQE6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Asf1aQ9CQE6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Asf1aQ9CQE6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Asf1aQ9CQE6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Asf1aQ9CQE6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Asf1aQ9CQE6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Asf1aQ9CQE6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Asf1aQ9CQE6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Asf1aQ9CQE6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Asf1aQ9CQE6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Asf1aQ9CQE6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Asf1aQ9CQE6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Asf1aQ9CQE6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Asf1aQ9CQE6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Asf1aQ9CQE6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Asf1aQ9CQE6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Asf1aQ9CQE6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Asf1aQ9CQE6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Asf1aQ9CQE6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Asf1aQ9CQE6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Asf1aQ9CQE6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Asf1aQ9CQE6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Asf1aQ9CQE6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Asf1aQ9CQE6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Asf1aQ9CQE6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Asf1aQ9CQE6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Asf1aQ9CQE6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Asf1aQ9CQE6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Asf1aQ9CQE6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Asf1aQ9CQE6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Asf1aQ9CQE6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Asf1aQ9CQE6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Asf1aQ9CQE6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Asf1aQ9CQE6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Asf1aQ9CQE6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Asf1aQ9CQE6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Asf1aQ9CQE6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Asf1aQ9CQE6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Asf1aQ9CQE6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Asf1aQ9CQE6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Asf1aQ9CQE6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Asf1aQ9CQE6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Asf1aQ9CQE6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Asf1aQ9CQE6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Asf1aQ9CQE6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Asf1aQ9CQE6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Asf1aQ9CQE6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Asf1aQ9CQE6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Asf1aQ9CQE6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Asf1aQ9CQE6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Asf1aQ9CQE6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Asf1aQ9CQE6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Asf1aQ9CQE6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Asf1aQ9CQE6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Asf1aQ9CQE6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Asf1aQ9CQE6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Asf1aQ9CQE6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Asf1aQ9CQE6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Asf1aQ9CQE6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Asf1aQ9CQE6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Asf1aQ9CQE6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Asf1aQ9CQE6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms