Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt88Q9CPR6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt88Q9CPR6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt88Q9CPR6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt88Q9CPR6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt88Q9CPR6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt88Q9CPR6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt88Q9CPR6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt88Q9CPR6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt88Q9CPR6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt88Q9CPR6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt88Q9CPR6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt88Q9CPR6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt88Q9CPR6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt88Q9CPR6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt88Q9CPR6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt88Q9CPR6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt88Q9CPR6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Krt88Q9CPR6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt88Q9CPR6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt88Q9CPR6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt88Q9CPR6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt88Q9CPR6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt88Q9CPR6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt88Q9CPR6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt88Q9CPR6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt88Q9CPR6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt88Q9CPR6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt88Q9CPR6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt88Q9CPR6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt88Q9CPR6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt88Q9CPR6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt88Q9CPR6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt88Q9CPR6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt88Q9CPR6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt88Q9CPR6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt88Q9CPR6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt88Q9CPR6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt88Q9CPR6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt88Q9CPR6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt88Q9CPR6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt88Q9CPR6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt88Q9CPR6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt88Q9CPR6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt88Q9CPR6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt88Q9CPR6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt88Q9CPR6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt88Q9CPR6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt88Q9CPR6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Krt88Q9CPR6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Krt88Q9CPR6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Krt88Q9CPR6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Krt88Q9CPR6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Krt88Q9CPR6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Krt88Q9CPR6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Krt88Q9CPR6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Krt88Q9CPR6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Krt88Q9CPR6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Krt88Q9CPR6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Krt88Q9CPR6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Krt88Q9CPR6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Krt88Q9CPR6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Krt88Q9CPR6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Krt88Q9CPR6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Krt88Q9CPR6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Krt88Q9CPR6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Krt88Q9CPR6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Krt88Q9CPR6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Krt88Q9CPR6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Krt88Q9CPR6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Krt88Q9CPR6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Krt88Q9CPR6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Krt88Q9CPR6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Krt88Q9CPR6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Krt88Q9CPR6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Krt88Q9CPR6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Krt88Q9CPR6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Krt88Q9CPR6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Krt88Q9CPR6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Krt88Q9CPR6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Krt88Q9CPR6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Krt88Q9CPR6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Krt88Q9CPR6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Krt88Q9CPR6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Krt88Q9CPR6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Krt88Q9CPR6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Krt88Q9CPR6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Krt88Q9CPR6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Krt88Q9CPR6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt88Q9CPR6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt88Q9CPR6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt88Q9CPR6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt88Q9CPR6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Krt88Q9CPR6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Krt88Q9CPR6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Krt88Q9CPR6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Krt88Q9CPR6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Krt88Q9CPR6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Krt88Q9CPR6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Krt88Q9CPR6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112 ms