Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chmp1b1Q99LU0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chmp1b1Q99LU0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp1b1Q99LU0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp1b1Q99LU0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp1b1Q99LU0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp1b1Q99LU0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chmp1b1Q99LU0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chmp1b1Q99LU0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp1b1Q99LU0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp1b1Q99LU0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp1b1Q99LU0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp1b1Q99LU0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp1b1Q99LU0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp1b1Q99LU0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp1b1Q99LU0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp1b1Q99LU0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp1b1Q99LU0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp1b1Q99LU0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp1b1Q99LU0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp1b1Q99LU0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp1b1Q99LU0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chmp1b1Q99LU0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chmp1b1Q99LU0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chmp1b1Q99LU0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chmp1b1Q99LU0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chmp1b1Q99LU0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chmp1b1Q99LU0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chmp1b1Q99LU0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chmp1b1Q99LU0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chmp1b1Q99LU0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chmp1b1Q99LU0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chmp1b1Q99LU0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chmp1b1Q99LU0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Chmp1b1Q99LU0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chmp1b1Q99LU0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chmp1b1Q99LU0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chmp1b1Q99LU0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chmp1b1Q99LU0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chmp1b1Q99LU0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Chmp1b1Q99LU0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chmp1b1Q99LU0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chmp1b1Q99LU0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chmp1b1Q99LU0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chmp1b1Q99LU0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Chmp1b1Q99LU0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Chmp1b1Q99LU0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Chmp1b1Q99LU0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chmp1b1Q99LU0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chmp1b1Q99LU0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chmp1b1Q99LU0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chmp1b1Q99LU0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chmp1b1Q99LU0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chmp1b1Q99LU0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chmp1b1Q99LU0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chmp1b1Q99LU0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Chmp1b1Q99LU0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chmp1b1Q99LU0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chmp1b1Q99LU0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chmp1b1Q99LU0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chmp1b1Q99LU0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chmp1b1Q99LU0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chmp1b1Q99LU0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chmp1b1Q99LU0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chmp1b1Q99LU0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chmp1b1Q99LU0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chmp1b1Q99LU0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chmp1b1Q99LU0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chmp1b1Q99LU0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chmp1b1Q99LU0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chmp1b1Q99LU0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chmp1b1Q99LU0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chmp1b1Q99LU0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chmp1b1Q99LU0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chmp1b1Q99LU0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chmp1b1Q99LU0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chmp1b1Q99LU0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chmp1b1Q99LU0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chmp1b1Q99LU0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chmp1b1Q99LU0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chmp1b1Q99LU0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chmp1b1Q99LU0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chmp1b1Q99LU0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chmp1b1Q99LU0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chmp1b1Q99LU0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Chmp1b1Q99LU0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chmp1b1Q99LU0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chmp1b1Q99LU0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chmp1b1Q99LU0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chmp1b1Q99LU0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chmp1b1Q99LU0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chmp1b1Q99LU0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chmp1b1Q99LU0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chmp1b1Q99LU0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chmp1b1Q99LU0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chmp1b1Q99LU0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chmp1b1Q99LU0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chmp1b1Q99LU0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chmp1b1Q99LU0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chmp1b1Q99LU0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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