Protein–RNA interactions for Protein: Q99J56

Derl1, Derlin-1, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl1Q99J56 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Derl1Q99J56 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Derl1Q99J56 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Derl1Q99J56 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Derl1Q99J56 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Derl1Q99J56 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Derl1Q99J56 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Derl1Q99J56 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Derl1Q99J56 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Derl1Q99J56 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Derl1Q99J56 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Derl1Q99J56 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Derl1Q99J56 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Derl1Q99J56 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Derl1Q99J56 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Derl1Q99J56 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Derl1Q99J56 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Derl1Q99J56 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Derl1Q99J56 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Derl1Q99J56 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Derl1Q99J56 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Derl1Q99J56 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Derl1Q99J56 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Derl1Q99J56 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Derl1Q99J56 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Derl1Q99J56 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Derl1Q99J56 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Derl1Q99J56 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Derl1Q99J56 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Derl1Q99J56 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Derl1Q99J56 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Derl1Q99J56 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Derl1Q99J56 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Derl1Q99J56 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Derl1Q99J56 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Derl1Q99J56 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Derl1Q99J56 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Derl1Q99J56 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Derl1Q99J56 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Derl1Q99J56 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Derl1Q99J56 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Derl1Q99J56 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Derl1Q99J56 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Derl1Q99J56 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Derl1Q99J56 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Derl1Q99J56 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Derl1Q99J56 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Derl1Q99J56 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Derl1Q99J56 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Derl1Q99J56 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Derl1Q99J56 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Derl1Q99J56 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Derl1Q99J56 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Derl1Q99J56 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Derl1Q99J56 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Derl1Q99J56 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Derl1Q99J56 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Derl1Q99J56 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Derl1Q99J56 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Derl1Q99J56 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Derl1Q99J56 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Derl1Q99J56 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Derl1Q99J56 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Derl1Q99J56 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Derl1Q99J56 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Derl1Q99J56 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Derl1Q99J56 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Derl1Q99J56 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Derl1Q99J56 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Derl1Q99J56 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Derl1Q99J56 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Derl1Q99J56 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Derl1Q99J56 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Derl1Q99J56 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Derl1Q99J56 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Derl1Q99J56 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Derl1Q99J56 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Derl1Q99J56 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Derl1Q99J56 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Derl1Q99J56 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Derl1Q99J56 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Derl1Q99J56 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Derl1Q99J56 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Derl1Q99J56 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Derl1Q99J56 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Derl1Q99J56 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Derl1Q99J56 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Derl1Q99J56 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Derl1Q99J56 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Derl1Q99J56 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Derl1Q99J56 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Derl1Q99J56 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Derl1Q99J56 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Derl1Q99J56 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Derl1Q99J56 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Derl1Q99J56 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Derl1Q99J56 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Derl1Q99J56 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Derl1Q99J56 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Derl1Q99J56 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms