Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Snx18Q91ZR2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Snx18Q91ZR2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Snx18Q91ZR2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Snx18Q91ZR2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Snx18Q91ZR2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Snx18Q91ZR2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Snx18Q91ZR2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Snx18Q91ZR2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Snx18Q91ZR2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Snx18Q91ZR2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Snx18Q91ZR2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Snx18Q91ZR2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Snx18Q91ZR2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Snx18Q91ZR2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Snx18Q91ZR2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Snx18Q91ZR2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Snx18Q91ZR2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Snx18Q91ZR2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Snx18Q91ZR2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Snx18Q91ZR2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Snx18Q91ZR2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Snx18Q91ZR2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Snx18Q91ZR2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Snx18Q91ZR2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Snx18Q91ZR2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Snx18Q91ZR2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Snx18Q91ZR2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Snx18Q91ZR2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Snx18Q91ZR2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Snx18Q91ZR2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Snx18Q91ZR2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Snx18Q91ZR2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Snx18Q91ZR2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Snx18Q91ZR2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Snx18Q91ZR2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snx18Q91ZR2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snx18Q91ZR2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snx18Q91ZR2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snx18Q91ZR2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snx18Q91ZR2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Snx18Q91ZR2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snx18Q91ZR2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snx18Q91ZR2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snx18Q91ZR2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Snx18Q91ZR2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snx18Q91ZR2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snx18Q91ZR2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Snx18Q91ZR2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snx18Q91ZR2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snx18Q91ZR2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snx18Q91ZR2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snx18Q91ZR2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snx18Q91ZR2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snx18Q91ZR2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Snx18Q91ZR2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Snx18Q91ZR2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Snx18Q91ZR2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snx18Q91ZR2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snx18Q91ZR2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snx18Q91ZR2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Snx18Q91ZR2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snx18Q91ZR2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Snx18Q91ZR2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Snx18Q91ZR2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snx18Q91ZR2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snx18Q91ZR2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snx18Q91ZR2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snx18Q91ZR2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snx18Q91ZR2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snx18Q91ZR2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Snx18Q91ZR2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Snx18Q91ZR2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Snx18Q91ZR2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Snx18Q91ZR2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Snx18Q91ZR2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Snx18Q91ZR2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Snx18Q91ZR2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Snx18Q91ZR2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Snx18Q91ZR2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Snx18Q91ZR2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Snx18Q91ZR2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Snx18Q91ZR2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Snx18Q91ZR2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Snx18Q91ZR2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Snx18Q91ZR2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Snx18Q91ZR2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Snx18Q91ZR2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Snx18Q91ZR2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Snx18Q91ZR2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Snx18Q91ZR2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Snx18Q91ZR2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Snx18Q91ZR2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Snx18Q91ZR2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Snx18Q91ZR2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Snx18Q91ZR2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Snx18Q91ZR2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Snx18Q91ZR2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Snx18Q91ZR2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Snx18Q91ZR2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms