Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDV0

Itgbl1, Integrin beta-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgbl1Q8VDV0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Itgbl1Q8VDV0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Itgbl1Q8VDV0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26,79■■□□□ 1,88
Itgbl1Q8VDV0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26,79■■□□□ 1,88
Itgbl1Q8VDV0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Itgbl1Q8VDV0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Itgbl1Q8VDV0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,77■■□□□ 1,88
Itgbl1Q8VDV0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26,77■■□□□ 1,88
Itgbl1Q8VDV0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26,77■■□□□ 1,88
Itgbl1Q8VDV0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Itgbl1Q8VDV0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26,77■■□□□ 1,88
Itgbl1Q8VDV0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Itgbl1Q8VDV0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Itgbl1Q8VDV0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26,76■■□□□ 1,87
Itgbl1Q8VDV0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Itgbl1Q8VDV0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Itgbl1Q8VDV0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Itgbl1Q8VDV0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26,75■■□□□ 1,87
Itgbl1Q8VDV0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Itgbl1Q8VDV0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Itgbl1Q8VDV0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26,74■■□□□ 1,87
Itgbl1Q8VDV0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Itgbl1Q8VDV0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26,73■■□□□ 1,87
Itgbl1Q8VDV0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,72■■□□□ 1,87
Itgbl1Q8VDV0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Itgbl1Q8VDV0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Itgbl1Q8VDV0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Itgbl1Q8VDV0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Itgbl1Q8VDV0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,87
Itgbl1Q8VDV0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,87
Itgbl1Q8VDV0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,86
Itgbl1Q8VDV0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,86
Itgbl1Q8VDV0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
Itgbl1Q8VDV0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
Itgbl1Q8VDV0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,67■■□□□ 1,86
Itgbl1Q8VDV0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Itgbl1Q8VDV0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Itgbl1Q8VDV0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Itgbl1Q8VDV0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Itgbl1Q8VDV0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Itgbl1Q8VDV0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Itgbl1Q8VDV0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,86
Itgbl1Q8VDV0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26,64■■□□□ 1,86
Itgbl1Q8VDV0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,86
Itgbl1Q8VDV0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,86
Itgbl1Q8VDV0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Itgbl1Q8VDV0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Itgbl1Q8VDV0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26,61■■□□□ 1,85
Itgbl1Q8VDV0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26,61■■□□□ 1,85
Itgbl1Q8VDV0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,61■■□□□ 1,85
Itgbl1Q8VDV0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Itgbl1Q8VDV0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Itgbl1Q8VDV0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26,6■■□□□ 1,85
Itgbl1Q8VDV0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
Itgbl1Q8VDV0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
Itgbl1Q8VDV0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,6■■□□□ 1,85
Itgbl1Q8VDV0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Itgbl1Q8VDV0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Itgbl1Q8VDV0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
Itgbl1Q8VDV0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26,58■■□□□ 1,85
Itgbl1Q8VDV0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Itgbl1Q8VDV0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Itgbl1Q8VDV0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26,57■■□□□ 1,84
Itgbl1Q8VDV0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,57■■□□□ 1,84
Itgbl1Q8VDV0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Itgbl1Q8VDV0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26,56■■□□□ 1,84
Itgbl1Q8VDV0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Itgbl1Q8VDV0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,55■■□□□ 1,84
Itgbl1Q8VDV0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Itgbl1Q8VDV0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26,55■■□□□ 1,84
Itgbl1Q8VDV0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Itgbl1Q8VDV0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Itgbl1Q8VDV0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26,54■■□□□ 1,84
Itgbl1Q8VDV0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Itgbl1Q8VDV0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26,54■■□□□ 1,84
Itgbl1Q8VDV0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26,54■■□□□ 1,84
Itgbl1Q8VDV0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Itgbl1Q8VDV0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Itgbl1Q8VDV0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Itgbl1Q8VDV0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Itgbl1Q8VDV0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26,53■■□□□ 1,84
Itgbl1Q8VDV0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Itgbl1Q8VDV0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
Itgbl1Q8VDV0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26,51■■□□□ 1,83
Itgbl1Q8VDV0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26,51■■□□□ 1,83
Itgbl1Q8VDV0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Itgbl1Q8VDV0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26,49■■□□□ 1,83
Itgbl1Q8VDV0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,49■■□□□ 1,83
Itgbl1Q8VDV0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Itgbl1Q8VDV0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Itgbl1Q8VDV0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26,49■■□□□ 1,83
Itgbl1Q8VDV0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26,48■■□□□ 1,83
Itgbl1Q8VDV0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
Itgbl1Q8VDV0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26,47■■□□□ 1,83
Itgbl1Q8VDV0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,47■■□□□ 1,83
Itgbl1Q8VDV0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Itgbl1Q8VDV0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Itgbl1Q8VDV0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Itgbl1Q8VDV0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
Itgbl1Q8VDV0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26,46■■□□□ 1,83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,5 ms