Protein–RNA interactions for Protein: Q8R570

Snap47, Synaptosomal-associated protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap47Q8R570 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Snap47Q8R570 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Snap47Q8R570 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Snap47Q8R570 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Snap47Q8R570 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Snap47Q8R570 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Snap47Q8R570 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Snap47Q8R570 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Snap47Q8R570 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Snap47Q8R570 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Snap47Q8R570 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Snap47Q8R570 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Snap47Q8R570 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Snap47Q8R570 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Snap47Q8R570 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Snap47Q8R570 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Snap47Q8R570 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Snap47Q8R570 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Snap47Q8R570 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Snap47Q8R570 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Snap47Q8R570 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Snap47Q8R570 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Snap47Q8R570 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Snap47Q8R570 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Snap47Q8R570 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Snap47Q8R570 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Snap47Q8R570 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Snap47Q8R570 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Snap47Q8R570 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Snap47Q8R570 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Snap47Q8R570 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Snap47Q8R570 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Snap47Q8R570 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Snap47Q8R570 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Snap47Q8R570 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Snap47Q8R570 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Snap47Q8R570 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Snap47Q8R570 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Snap47Q8R570 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Snap47Q8R570 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Snap47Q8R570 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Snap47Q8R570 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Snap47Q8R570 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Snap47Q8R570 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Snap47Q8R570 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Snap47Q8R570 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Snap47Q8R570 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Snap47Q8R570 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Snap47Q8R570 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Snap47Q8R570 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Snap47Q8R570 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Snap47Q8R570 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Snap47Q8R570 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Snap47Q8R570 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Snap47Q8R570 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Snap47Q8R570 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Snap47Q8R570 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Snap47Q8R570 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Snap47Q8R570 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Snap47Q8R570 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Snap47Q8R570 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Snap47Q8R570 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Snap47Q8R570 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Snap47Q8R570 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Snap47Q8R570 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Snap47Q8R570 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Snap47Q8R570 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Snap47Q8R570 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Snap47Q8R570 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Snap47Q8R570 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Snap47Q8R570 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Snap47Q8R570 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Snap47Q8R570 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Snap47Q8R570 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Snap47Q8R570 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Snap47Q8R570 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Snap47Q8R570 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Snap47Q8R570 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Snap47Q8R570 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Snap47Q8R570 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Snap47Q8R570 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Snap47Q8R570 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Snap47Q8R570 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Snap47Q8R570 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Snap47Q8R570 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Snap47Q8R570 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Snap47Q8R570 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Snap47Q8R570 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Snap47Q8R570 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Snap47Q8R570 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Snap47Q8R570 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Snap47Q8R570 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Snap47Q8R570 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Snap47Q8R570 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Snap47Q8R570 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Snap47Q8R570 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Snap47Q8R570 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Snap47Q8R570 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Snap47Q8R570 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Snap47Q8R570 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms