Protein–RNA interactions for Protein: Q8R322

Gle1, Nucleoporin GLE1, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gle1Q8R322 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gle1Q8R322 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gle1Q8R322 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gle1Q8R322 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gle1Q8R322 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gle1Q8R322 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gle1Q8R322 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Gle1Q8R322 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Gle1Q8R322 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gle1Q8R322 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gle1Q8R322 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gle1Q8R322 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gle1Q8R322 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gle1Q8R322 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gle1Q8R322 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gle1Q8R322 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gle1Q8R322 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Gle1Q8R322 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gle1Q8R322 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gle1Q8R322 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gle1Q8R322 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gle1Q8R322 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gle1Q8R322 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gle1Q8R322 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gle1Q8R322 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gle1Q8R322 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gle1Q8R322 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gle1Q8R322 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gle1Q8R322 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gle1Q8R322 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gle1Q8R322 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gle1Q8R322 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gle1Q8R322 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Gle1Q8R322 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gle1Q8R322 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gle1Q8R322 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gle1Q8R322 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gle1Q8R322 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gle1Q8R322 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gle1Q8R322 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gle1Q8R322 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gle1Q8R322 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gle1Q8R322 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Gle1Q8R322 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gle1Q8R322 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gle1Q8R322 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gle1Q8R322 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Gle1Q8R322 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gle1Q8R322 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gle1Q8R322 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gle1Q8R322 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gle1Q8R322 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gle1Q8R322 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gle1Q8R322 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gle1Q8R322 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gle1Q8R322 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gle1Q8R322 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gle1Q8R322 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gle1Q8R322 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gle1Q8R322 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gle1Q8R322 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gle1Q8R322 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gle1Q8R322 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gle1Q8R322 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gle1Q8R322 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gle1Q8R322 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gle1Q8R322 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gle1Q8R322 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gle1Q8R322 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gle1Q8R322 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gle1Q8R322 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gle1Q8R322 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gle1Q8R322 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gle1Q8R322 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gle1Q8R322 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gle1Q8R322 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gle1Q8R322 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gle1Q8R322 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gle1Q8R322 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gle1Q8R322 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gle1Q8R322 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gle1Q8R322 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gle1Q8R322 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gle1Q8R322 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gle1Q8R322 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gle1Q8R322 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Gle1Q8R322 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gle1Q8R322 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gle1Q8R322 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gle1Q8R322 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gle1Q8R322 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gle1Q8R322 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gle1Q8R322 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gle1Q8R322 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gle1Q8R322 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gle1Q8R322 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gle1Q8R322 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gle1Q8R322 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gle1Q8R322 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gle1Q8R322 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms