Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4L4

Pof1b, Protein POF1B, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pof1bQ8K4L4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Pof1bQ8K4L4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pof1bQ8K4L4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pof1bQ8K4L4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pof1bQ8K4L4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pof1bQ8K4L4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Pof1bQ8K4L4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pof1bQ8K4L4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pof1bQ8K4L4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pof1bQ8K4L4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pof1bQ8K4L4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pof1bQ8K4L4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pof1bQ8K4L4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pof1bQ8K4L4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pof1bQ8K4L4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pof1bQ8K4L4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pof1bQ8K4L4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pof1bQ8K4L4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pof1bQ8K4L4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pof1bQ8K4L4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pof1bQ8K4L4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pof1bQ8K4L4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pof1bQ8K4L4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pof1bQ8K4L4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pof1bQ8K4L4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pof1bQ8K4L4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pof1bQ8K4L4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pof1bQ8K4L4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pof1bQ8K4L4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pof1bQ8K4L4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pof1bQ8K4L4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pof1bQ8K4L4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pof1bQ8K4L4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pof1bQ8K4L4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pof1bQ8K4L4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pof1bQ8K4L4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pof1bQ8K4L4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pof1bQ8K4L4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pof1bQ8K4L4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pof1bQ8K4L4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pof1bQ8K4L4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pof1bQ8K4L4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pof1bQ8K4L4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pof1bQ8K4L4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pof1bQ8K4L4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pof1bQ8K4L4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pof1bQ8K4L4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pof1bQ8K4L4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pof1bQ8K4L4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pof1bQ8K4L4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pof1bQ8K4L4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pof1bQ8K4L4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pof1bQ8K4L4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pof1bQ8K4L4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Pof1bQ8K4L4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pof1bQ8K4L4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pof1bQ8K4L4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Pof1bQ8K4L4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Pof1bQ8K4L4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Pof1bQ8K4L4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pof1bQ8K4L4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pof1bQ8K4L4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pof1bQ8K4L4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Pof1bQ8K4L4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pof1bQ8K4L4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pof1bQ8K4L4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pof1bQ8K4L4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pof1bQ8K4L4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pof1bQ8K4L4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pof1bQ8K4L4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pof1bQ8K4L4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Pof1bQ8K4L4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Pof1bQ8K4L4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Pof1bQ8K4L4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pof1bQ8K4L4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pof1bQ8K4L4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Pof1bQ8K4L4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pof1bQ8K4L4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pof1bQ8K4L4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pof1bQ8K4L4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pof1bQ8K4L4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pof1bQ8K4L4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pof1bQ8K4L4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Pof1bQ8K4L4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pof1bQ8K4L4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pof1bQ8K4L4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pof1bQ8K4L4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pof1bQ8K4L4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pof1bQ8K4L4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Pof1bQ8K4L4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pof1bQ8K4L4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pof1bQ8K4L4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pof1bQ8K4L4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pof1bQ8K4L4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pof1bQ8K4L4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pof1bQ8K4L4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pof1bQ8K4L4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pof1bQ8K4L4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pof1bQ8K4L4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pof1bQ8K4L4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms